Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
CCDC18Q5T9S5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC18Q5T9S5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms