Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC183Q5T5S1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC183Q5T5S1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms