Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4T6

SYCP2L, Synaptonemal complex protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2LQ5T4T6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SYCP2LQ5T4T6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2LQ5T4T6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms