Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRAPPC3LQ5T215 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAPPC3LQ5T215 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAPPC3LQ5T215 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms