Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HP1BP3Q5SSJ5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms