Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC158Q5M9N0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC158Q5M9N0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC158Q5M9N0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms