Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HABP4Q5JVS0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HABP4Q5JVS0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms