Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTL5Q5HYW3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTL5Q5HYW3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms