Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX6

SLC45A4, Solute carrier family 45 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC45A4Q5BKX6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC45A4Q5BKX6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC45A4Q5BKX6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC45A4Q5BKX6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms