Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COBLL1Q53SF7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
COBLL1Q53SF7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
COBLL1Q53SF7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms