Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ZNF260Q3ZCT1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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