Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KRTAP13-3Q3SY46 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
KRTAP13-3Q3SY46 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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