Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LINC00303Q3SY05 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LINC00303Q3SY05 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms