Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRRFIP1Q32MZ4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRRFIP1Q32MZ4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms