Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPEL1Q2QD12 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms