Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC142Q17RM4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC142Q17RM4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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