Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL23Q16540 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL23Q16540 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms