Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SF3B3Q15393 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
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