Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDGFRLQ15198 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDGFRLQ15198 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms