Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDCD1Q15116 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDCD1Q15116 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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