Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
HERC3Q15034 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
HERC3Q15034 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
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