Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HDM1Q15032 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HDM1Q15032 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HDM1Q15032 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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