Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SHPRHQ149N8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SHPRHQ149N8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms