Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHD4Q14839 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHD4Q14839 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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