Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD9Q14511 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NEDD9Q14511 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
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