Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BECN1Q14457 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BECN1Q14457 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
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