Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC2Q13868 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
EXOSC2Q13868 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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