Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PKP1Q13835 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PKP1Q13835 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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