Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CUL1Q13616 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CUL1Q13616 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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