Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MTMR3Q13615 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MTMR3Q13615 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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