Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATRQ13535 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ATRQ13535 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATRQ13535 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ATRQ13535 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATRQ13535 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
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