Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRPF4BQ13523 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
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