Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NAB1Q13506 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NAB1Q13506 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NAB1Q13506 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NAB1Q13506 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms