Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
XRCC4Q13426 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC4Q13426 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
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