Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SCGB2A2Q13296 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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SCGB2A2Q13296 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SCGB2A2Q13296 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SCGB2A2Q13296 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
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