Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRDNQ13061 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
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