Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GRIK3Q13003 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK3Q13003 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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