Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CSTF3Q12996 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CSTF3Q12996 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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