Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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BNIP1Q12981 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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BNIP1Q12981 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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BNIP1Q12981 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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BNIP1Q12981 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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BNIP1Q12981 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
BNIP1Q12981 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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