Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
FOXC1Q12948 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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FOXC1Q12948 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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FOXC1Q12948 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FOXC1Q12948 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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