Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAB40BQ12829 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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RAB40BQ12829 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RAB40BQ12829 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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