Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 RPS13YDR064W 456 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YDR535CYDR535C 501 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 GTR2YGR163W 1026 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 FUR1YHR128W 651 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PPX1YHR201C 1194 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MRPL49YJL096W 486 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MET14YKL001C 609 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RPL14AYKL006W 417 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 SWD2YKL018W 990 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MBR1YKL093W 1020 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 ISA1YLL027W 753 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PSF3YOL146W 585 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 AGA1YNR044W 2178 nt4.51□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 ERG9YHR190W 1335 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RPL35BYDL136W 363 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 CWC2YDL209C 1020 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 EMC4YGL231C 573 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 COX2Q0250 756 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MMF1YIL051C 438 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 FOL3YMR113W 1284 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YMR187CYMR187C 1296 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 FIG1YBR040W 897 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MIG1YGL035C 1515 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 POL1YNL102W 4407 nt4.5□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PRS5YOL061W 1491 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 ALO1YML086C 1581 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 CET1YPL228W 1650 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 GRX3YDR098C 858 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YFL051CYFL051C 483 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YGR226CYGR226C 210 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 ERV29YGR284C 933 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YPT52YKR014C 705 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YML116W-AYML116W-A 303 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 TUM1YOR251C 915 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YOR364WYOR364W 369 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 VAC7YNL054W 3498 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 VPS45YGL095C 1734 nt4.49□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 HAP4YKL109W 1665 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 CIK1YMR198W 1785 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MIS1YBR084W 2928 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 NOP6YDL213C 678 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PRE1YER012W 597 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 COG2YGR120C 789 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RPL27AYHR010W 411 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YKE4YIL023C 1041 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 REE1YJL217W 597 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 AUR1YKL004W 1206 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 NRK1YNL129W 723 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RPS19AYOL121C 435 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 CLG1YGL215W 1359 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PMC1YGL006W 3522 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 TRF5YNL299W 1929 nt4.48□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 VPS38YLR360W 1320 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RCR2YDR003W 633 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RPC11YDR045C 333 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 SOL4YGR248W 768 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 IGO2YHR132W-A 396 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 PEX18YHR160C 852 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 YKL202WYKL202W 582 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 FLD1YLR404W 858 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 RRT1YBL048W 312 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 VPS27YNR006W 1869 nt4.47□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 EMP47YFL048C 1338 nt4.46□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 AIM21YIR003W 2040 nt4.46□□□□□ -1.69
CLF1Q12309 MCM1YMR043W 861 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 GAL7YBR018C 1101 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 SPR2YOR214C 711 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PPT2YPL148C 522 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 MCM16YPR046W 546 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RIB5YBR256C 717 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PIM1YBL022C 3402 nt4.46□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 GRS2YPR081C 1857 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YDR131CYDR131C 1671 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 APN2YBL019W 1563 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YCR108CYCR108C 192 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RPL13AYDL082W 600 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 WBP1YEL002C 1293 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 IES6YEL044W 501 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YGL242CYGL242C 546 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 CAP1YKL007W 807 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YAR069CYAR069C 294 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YNR071CYNR071C 1029 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 TMC1YOR052C 453 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 SLI1YGR212W 1407 nt4.45□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YPR003CYPR003C 2265 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 MNR2YKL064W 2910 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 PUB1YNL016W 1362 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 MSW1YDR268W 1140 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YER158W-AYER158W-A 216 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YHI9YHR029C 885 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 RNR2YJL026W 1200 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YJR157WYJR157W 363 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YLR217WYLR217W 324 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YLR428CYLR428C 345 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 DLT1YMR126C 1029 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 SGT1YOR057W 1188 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 YOR366WYOR366W 354 nt4.44□□□□□ -1.7
CLF1Q12309 SUR1YPL057C 1149 nt4.44□□□□□ -1.7
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