Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 SFB3YHR098C 2790 nt6.95□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YME1YPR024W 2244 nt6.95□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 ECM3YOR092W 1842 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 DSS1YMR287C 2910 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 GCR2YNL199C 1605 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 NHP2YDL208W 471 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 CWC21YDR482C 408 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YGR182CYGR182C 354 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 RNH203YLR154C 333 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 COQ5YML110C 924 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 RPL13BYMR142C 600 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YJR015WYJR015W 1533 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 MAL11YGR289C 1851 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 SSL1YLR005W 1386 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 SOG2YOR353C 2376 nt6.94□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 MNN5YJL186W 1761 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 BRE2YLR015W 1518 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 MPH2YDL247W 1830 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 COX26YDR119W-A 201 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 BUD13YGL174W 801 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YGR228WYGR228W 345 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 RIO2YNL207W 1278 nt6.93□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 MMT1YMR177W 1533 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 FAR8YMR029C 1572 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 RPA14YDR156W 414 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 PRO3YER023W 861 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YGR017WYGR017W 894 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YKL223WYKL223W 333 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YAR029WYAR029W 225 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 GLO1YML004C 981 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 ASI2YNL159C 870 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 snR54snR54 86 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 UBX2YML013W 1755 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 OCT1YKL134C 2319 nt6.92□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YJR098CYJR098C 1971 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 GPT2YKR067W 2232 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 FMN1YDR236C 657 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 MIC26YGR235C 702 nt6.91□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YDL034WYDL034W 345 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)CtN(GUU)C 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)FtN(GUU)F 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)GtN(GUU)G 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)KtN(GUU)K 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)LtN(GUU)L 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)N1tN(GUU)N1 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)N2tN(GUU)N2 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)O1tN(GUU)O1 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)O2tN(GUU)O2 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 tN(GUU)PtN(GUU)P 74 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YOL160WYOL160W 342 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 GRX7YBR014C 612 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 SPN1YPR133C 1233 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 snR24snR24 89 nt6.9□□□□□ -1.3
NOP53Q12080 YHL017WYHL017W 1599 nt6.9□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YDR413CYDR413C 576 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 ATP8Q0080 147 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YER107W-AYER107W-A 321 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 SLO1YER180C-A 258 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 RPS2YGL123W 765 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YHL049CYHL049C 816 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 STM1YLR150W 822 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 BSC3YLR465C 309 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YOL097W-AYOL097W-A 186 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 CKA2YOR061W 1020 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YPL062WYPL062W 405 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 INA17YPL099C 549 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YPR148CYPR148C 1308 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 HCM1YCR065W 1695 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 VPS1YKR001C 2115 nt6.89□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YER175W-AYER175W-A 165 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 RPS25AYGR027C 327 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 MAK16YAL025C 921 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 COX17YLL009C 210 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 UNG1YML021C 1080 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 KEX2YNL238W 2445 nt6.88□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 SRP1YNL189W 1629 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YCR013CYCR013C 648 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 RRP45YDR280W 918 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 TPK3YKL166C 1197 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 RPS19AYOL121C 435 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 MRM1YOR201C 1239 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YOR318CYOR318C 306 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 TAF14YPL129W 735 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 TAX4YJL083W 1815 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 SSK22YCR073C 3996 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 CEX1YOR112W 2286 nt6.87□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 ERG7YHR072W 2196 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 SKO1YNL167C 1944 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 SWT1YOR166C 1377 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 GRX2YDR513W 432 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YGR107WYGR107W 450 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 ECM4YKR076W 1113 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YPL035CYPL035C 348 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YPR123CYPR123C 435 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 AIM4YBR194W 372 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 YBR209WYBR209W 318 nt6.86□□□□□ -1.31
NOP53Q12080 VNX1YNL321W 2727 nt6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.7 ms