Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBL2Q08999 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBL2Q08999 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms