Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SPOCK1Q08629 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPOCK1Q08629 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms