Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ACTN3Q08043 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms