Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EGR3Q06889 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
EGR3Q06889 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.9 ms