Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LTBQ06643 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LTBQ06643 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LTBQ06643 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LTBQ06643 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
LTBQ06643 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms