Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABPB1Q06547 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABPB1Q06547 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms