Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
TNP2Q05952 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TNP2Q05952 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms